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短信服务取消了仍然扣费的原因可能有以下几种情况。
1、套餐费用：如果办理的是按月收取的套餐，即使取消了短信功能，套餐费用仍然会收取，需要确认短信服务的取消是否涉及到了套餐的更改或取消。
2、服务未成功取消：如果服务没有成功取消，那么运营商会继续收取相关费用，建议查询服务是否成功取消。
3、延迟处理：在取消服务后的一段时间内，运营商可能仍在处理之前的短信服务费用，这种情况通常只会收取一次费用，不会持续扣费。
4、其他费用：可能还存在一些与短信服务相关的其他费用，如短信数量超过套餐包含的免费数量后的费用或者接收某些特定短信的费用等。
为了解决这个问题，建议直接联系运营商的客服部门，查询具体的扣费原因，并要求给出明确的解释和解决方案，这样可以确保问题得到及时解决。